Les traces d'urbanisation en Macédoine, Epire, et surtout en Thessalie, attestent d'une sédentarisation progressive.

Les collines arrondies de Thessalie (les magoulas) révéleront plusieurs mètres de vestiges correspondant à divers niveaux d'occupation. Les plus anciennement connues, Sesklo et Dimini, dans le golfe de Volo, donneront leur nom aux deux phases principales du néolithique thessalien.

• Site de Sesklo
La phase de Sesklo (Vème millénaire) se distingue par la production de céramique évoluée. Les formes, encore primitives, sont décorées de motifs géométriques d'ordinaire appliqués en rouge sur un fond blanc. La spirale venant d'Anatolie apparaît sur des sceaux trouvés dans les plus anciennes couches néolithiques. Les habitations comprennent une salle principale, rectangulaire ou carrée, précédée d'un porche dont l'auvent repose sur deux poteaux et sur les avancées des murs latéraux. Ce plan sera utilisé pour la construction de la partie centrale, ou mégaron, du palais continental à l'époque mycénienne.

• Site de Dimini
Le décor des céramiques est enrichi par l'introduction de la bichromie et l'apparition de motifs nouveaux dans la phase de Dimini (IVème millénaire). Le mégaron, lieu d'habitation du chef, constitue l'édifice principal du village. Il est construit sur une aire dégagée et en entouré de plusieurs enceintes concentriques.

Cette zone géographique livrera une importante quantité de statuettes, souvent de forme féminine. Les bras sont croisés sous les seins, figurés par deux petites protubérances, ou sur le ventre. Le sexe est représenté par des incisions. Elle livrera également des statuettes, plus rares, représentant un personnage assis, souvent de sexe masculin. Peut-être faut-il les considérer comme le complément mâle de la déesse de la fécondité. L'existence de fours, pouvant atteindre 1500°C, permettent la fusion de la plupart des métaux et la mise au point des premiers alliages. Il faut attendre la fin du Néolithique Récent pour retrouver à Képhala, dans l'île de Kéos, un habitat insulaire et surtout un cimetière.