Perché au sommet d'un méandre de Irrawaddy, la petite pagode de Bupaya sert de phare aux navigateurs du fleuve. Détruite à la suite d'un grave tremblement de terre en 1975, elle sera fidèlement reconstruite.
La forme bulbeuse du stupa de Bupaya s'apparente à celle de la pagode de Ngagwenadaung et de quelques stupas intérieurs construits à l'intérieur de pagodes fermées de la période de Pyu. Il est encerclé par une bande convexe et est couronné par un hti (parapluie).