Ce château sera construit en 1603 par le shogun Tokugawa Ieyasu pour protéger le palais impérial. Il en fera sa résidence lors de ses visites à Kyoto. Considérablement agrandi 1626, le château sera victime d'un manque d'entretien. Certains éléments seront déplaces ou démolis, tandis qu'un incendie détruira le donjon principal en 1750 et le Honmaru Goten (palais) en 1788.
Description
La propriété du château sera transférée au gouvernement national après la restauration Meiji en 1867, sous celle du gouvernement préfectoral de Kyoto en 1871. La Maison impériale le donnera à la ville de Kyoto en 1939.
Depuis lors, d'importants travaux de restauration seront entrepris. Le Nijo-jo est considéré comme un témoignage important de l'esprit de la culture Momoyama. Six des bâtiments du Ninomaru Goten (palais) épargnés par les incendies de 1788 sont classés Trésors Nationaux. Ce groupe est un chef d'oeuvre de l'architecture résidentielle shoin-zukuri, très appréciée les samouraïs. Il s'agit d'un ensemble de bâtiments accolés, disposés le long de l'étang du Ninomaru teien (jardin), classé Paysage d'une Particulière Beauté. Les 22 autres bâtiments construits dans l'enceinte du château sont considérés comme des Biens Culturels Importants.