L'empereur Ashoka construisit 8 stûpas sur le site au cours de son règne au IIIe siècle av. J.-C.. D'autres stûpas ainsi que d'autres bâtiments religieux bouddhistes, tels que des monastères, complétèrent le site jusqu'au XIIe siècle. Cependant, suite à la contre-réforme hindouiste, les monuments de Sânchî furent oubliés et se détériorèrent par manque d'entretien.
Le site est redécouvert en 1818 par un officier britannique, le général Taylor. Des archéologues amateurs et des chasseurs de trésor vont ravager la zone jusqu'en 1881 où des mesures de restauration sont entreprises. Entre 1912 et 1919, les structures sont remises dans l'état où on les connaît aujourd'hui sous la supervision de Sir John Marshall.
De nos jours, il reste cinquante monuments sur la colline de Sânchî, y compris 3 stûpas et plusieurs temples. Le Grand Stûpa est entouré de quatre portails sculptés appelés toranas.
Le site des Monuments bouddhiques de Sânchî est inscrit au patrimoine mondial de l'UNESCO depuis 1989.
